Degree

• Ph. D.（The University of Tokyo）

Research History

Education

Awards

• IPSJ Outstanding Paper Award（2024-03）
• Gordon Bell Prize (Winner, Low Price / Performance Category)（2009-11）
• Gordon Bell Prize (Honorable Mention, Peak Performance)（2006-11）
• Gordon Bell Prize (Winner, Peak Performance)（2000-11）
• AVS大賞（最優秀賞）（1996-09）

Others

Papers

• An Implementation and Evaluation of a Remote Control System for Logic Circuit Design Assignment using an FPGA（2022-06）
• Estimating Configuration Parameters of Pipelines for accelerating N-Body Simulations with an FPGA using High-level Synthesis（2019-09-19）
• CUDA offloading for energy‐efficient and high‐frame‐rate simulations using tablets（2019-08-23） [DOI]
• Structural determinants in the bulk heterojunction（2018） [DOI]
• An FPGA-Based Tiled Display System for a Wearable Display（2016） [Web of Scientce] [Othres link]
• Comparison of the Accuracy of Periodic Reaction Field Methods in Molecular Dynamics Simulations of a Model Liquid Crystal System（2015-12-15） [DOI]
• GPU-accelerated replica exchange molecular simulation on solid-liquid phase transition study of Lennard-Jones fluids（2015-08） [DOI] [Web of Scientce]
• Application of isotropic periodic sum method for 4-pentyl-4 '-cyanobiphenyl liquid crystal（2015-08） [DOI] [Web of Scientce]
• Acceleration of the Fast Multipole Method on FPGA Devices（2015-02） [DOI] [Web of Scientce]
• Acceleration of Othello Computer Game using an FPGA Tablet（2015） [DOI] [Web of Scientce]
• 1,024GPUを使用したレプリカ交換分子動力学シミュレーションの並列化（2014-12）
• Parallel Molecular Dynamics Simulation with Replica-Exchange Method using 1,024 GPUs（2014-12） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books] [Othres link]
• Petascale molecular dynamics simulation using the fast multipole method on K computer（2014-10） [DOI] [Web of Scientce]
• Petascale turbulence simulation using a highly parallel fast multipole method on GPUs（2013-03） [DOI]
• MD simulations on the structure of onco-proteins p53: Wild-type and radioresistant mutant systems（2013-01）
• Common force field thermodynamics of cholesterol（2013） [DOI] [PubMed]
• DS-CUDA: a Middleware to Use Many GPUs in the Cloud Environment（2012-11）
• GPU-accelerated computation of electron transfer（2012-11） [DOI] [Web of Scientce]
• An Improved Isotropic Periodic Sum Method That Uses Linear Combinations of Basis Potentials（2012-11） [DOI] [Web of Scientce]
• Optimization of Molecular Dynamics Core Program on the K computer（2012-09） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• Structural features of aquaporin 4 supporting the formation of arrays and junctions in biomembranes（2012-09） [DOI] [Web of Scientce]
• Distributed-Shared CUDA: Virtualization of Large-Scale GPU Systems for Programmability and Reliability（2012-07）
• DS-CUDA: a Middleware to Use Many GPUs in the Cloud Environment（2012） [DOI] [Web of Scientce]
• Cut-off radius effect of the isotropic periodic sum method for polar molecules in a bulk water system（2012） [DOI] [Web of Scientce]
• A combination of the tree-code and IPS method to simulate large scale systems by molecular dynamics（2011-11） [DOI] [Web of Scientce]
• FAST QUASI DOUBLE-PRECISION METHOD WITH SINGLE-PRECISION HARDWARE TO ACCELERATE SCIENTIFIC APPLICATIONS（2011-09） [DOI] [Web of Scientce]
• Fast Calculation of Electrostatic Potentials on the GPU or the ASIC MD-GRAPE-3（2011-07） [DOI] [Web of Scientce]
• Cutoff radius effect of the isotropic periodic sum and Wolf method in liquid-vapor interfaces of water（2011-05） [DOI] [Web of Scientce]
• Thermodynamic properties of methane/water interface predicted by molecular dynamics simulations（2011-04） [DOI] [Web of Scientce]
• Molecular dynamics simulations of vapor/liquid coexistence using the nonpolarizable water models（2011-03） [DOI] [Web of Scientce]
• CUTOFF RADIUS EFFECT OF WATER CONFIGURATION USING THE WOLF METHOD（2011） [Web of Scientce]
• Accelerating Molecular Dynamics Simulation Using Graphics Processing Unit（2010-12） [DOI] [Web of Scientce]
• Cutoff radius effect of the isotropic periodic sum method in homogeneous system. II. Water（2010-07） [DOI] [Web of Scientce]
• A 281 Tflops Calculation for X-ray Protein Structure Analysis with Special-Purpose Computers MDGRAPE-3（2010） [Web of Scientce]
• Current Performance Gains From Utilizing the GPU or the ASIC MDGRAPE-3 Within an Enhanced Poisson Boltzmann Approach（2009-11） [DOI] [Web of Scientce]
• Fast multipole methods on a cluster of GPUs for the meshless simulation of turbulence（2009-11） [DOI] [Web of Scientce]
• High-Performance Drug Discovery: Computational Screening by Combining Docking and Molecular Dynamics Simulations（2009-10） [DOI] [Web of Scientce]
• High-Performance Quasi Double-Precision Method using Single-Precision Hardware for Molecular Dynamics Simulations with GPUs（2009-03）
• Using Special-Purpose and Video-Game Computers for Accelerating Molecular Dynamics Simulations（2009） [Web of Scientce]
• 42 TFlops Hierarchical N-body Simulations on GPUs with Applications in both Astrophysics and Turbulence（2009） [Web of Scientce]
• グラフィックカードを用いた水表面張力の高速分子動力学シミュレーション（2009）
• JINR CICC in computational chemistry and nanotechnology problems: DL_POLY performance for different communication architectures（2009） [DOI]
• Knoppix for CUDA : a CD-bootable GPGPU training environment（2008-07-01） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books] [Othres link]
• Overheads in Accelerating Molecular Dynamics Simulations with GPUs（2008） [DOI] [Web of Scientce]
• Cell size dependence of orientational order of uniaxial liquid crystals in flat slit（2008） [DOI] [Web of Scientce]
• ACCELERATING MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS ON PLAYSTATION 3 PLATFORM USING VIRTUAL-GRAPE PROGRAMMING MODEL（2008） [DOI] [Web of Scientce]
• Cutoff radius effect of isotropic periodic sum method for transport coefficients of Lennard-Jones liquid（2007-09） [DOI] [Web of Scientce]
• Folding dynamics of 10-residue beta-hairpin peptide chignolin（2007） [DOI] [Web of Scientce]
• A 55 Tflops Simulation of Amyloid-forming Peptides from Yeast Prion Sup35 with the Special-Purpose Computer System MDGRAPE-3（2006-11） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• Structure and dynamics of RNA polymerase II elongation complex（2006-04） [DOI] [Web of Scientce]
• Novel mechanism of interaction of p85 subunit of phosphatidylinositol 3-kinase and ErbB3 receptor-derived phosphotyrosyl peptides（2005-01） [DOI] [Web of Scientce]
• Nanoscale hydrophobic interaction and nanobubble nucleation（2004-10） [DOI] [Web of Scientce]
• Simulations of magnetic materials with MDGRAPE-2（2004-03） [Web of Scientce]
• Tyr-317 phosphorylation increases shc structural rigidity and reduces coupling of domain motions remote from the phosphorylation site as revealed by molecular dynamics simulations（2004-02） [DOI] [Web of Scientce]
• 1P053 Proteomic Structural Analysis based on Molecular Dynamics Simulations : Protein-Protein Interactions of Ras-Raf and Ras-RalGDS com（2004） [DOI] [CiNii Research (CiNii Articles)]
• MDGRAPE-3: A petaflops special-purpose computer system for molecular dynamics simulations（2004） [Web of Scientce]
• Hardware accelerator for molecular dynamics: MDGRAPE-2（2003-10） [DOI] [Web of Scientce]
• Molecular dynamics study on class A beta-lactamase: Hydrogen bond network among the functional groups of penicillin G and side chains of the conserved residues in the active site（2003-09） [DOI] [Web of Scientce]
• Molecular dynamics, free energy, and SPR analyses of the interactions between the SH2 domain of grb2 and ErbB phosphotyrosyl peptides（2003-05） [DOI] [Web of Scientce]
• Parallelized Simulation of Molecular Dynamics with a Special-Purpose Computer: MDGRAPE-2（2003） [DOI] [CiNii Research (CiNii Articles)] [Othres link]
• Protein Explorer（2003） [DOI] [Othres link]
• Protein explorer: A petaflops special-purpose computer system for molecular dynamics simulations（2003） [DOI]
• Molecular Dynamics Simulations of Prion Proteins - Effect of Ala 117→Val Mutation -（2003）
• Numerical simulations of magnetic materials with MD-GRAPE: curvature induced anisotropy（2002-09） [Web of Scientce]
• A large scale molecular dynamics simulation for water with special-purpose computer MDM（2002） [Web of Scientce]
• Molecular dynamics study of the solidification process in alkali halide cluster（2002） [Web of Scientce]
• An 8.61 Tflop/s Molecular Dynamics Simulation for NaCl with a Special-Purpose Computer: MDM（2001-11） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• 1.34 Tflops Molecular Dynamics Simulation for NaCl with a Special-Purpose Computer: MDM（2000-11）
• 46 Tflops special-purpose computer for molecular dynamics simulations: WINE-2（2000） [Web of Scientce]
• Molecular dynamics machine: Special-purpose computer for molecular dynamics simulations（1999） [Web of Scientce]

Misc

• Fault-Tolerant Molecular Dynamics Simulation using Virtualized GPUs（2014-07-21） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books] [Othres link]
• G134 The electrostatic effect on ordering process of 4-pently-4'-cyanobiphenyl liquid crystal（2013-10-18） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books]
• CUDA Enabled for Android Tablets through DS-CUDA（2013-05-15） [CiNii Research (CiNii Articles)] [Othres link]
• 4096GPUを用いた4096³規模の一様等方性乱流の渦法解析（2012-07） [CiNii Research (CiNii Articles)] [Othres link]
• Turbulence Simulation Using 4096³ Vortex Particles on 4096 GPUs（2012-07） [CiNii Research (CiNii Articles)] [Othres link]
• Automatic Redundant Calculation with GPU Virtualization（2012-05-25） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books] [Othres link]
• Thermodynamic properties of methane/water interface predicted by molecular dynamics simulations (vol 134, 144702, 2011)（2011-12） [DOI] [Web of Scientce]
• Petascale Turbulence Simulation Using FMM（2011-11-21） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books] [Othres link]
• High-Performance Drug Discovery: Computational Screening by Combining Docking and Molecular Dynamics Simulations（2010-01） [Web of Scientce]
• Cell size dependence of orientational order of uniaxial liquid crystals in flat slit (vol 34, pg 761, 2008)（2010） [DOI] [Web of Scientce]
• 412 Implementation and Evaluation of Particle Mesh Ewald Method on GPU for Molecular Dynamics Simulation（2009-10-10） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books]
• アクセラレータによる粒子法シミュレーションの加速（2009-02）
• 618 Large Scale Molecular Dynamics Simulation using GPU（2008-11-01） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books]
• MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION OF WATER INTERFACE（2008-10-08） [CiNii Research (CiNii Articles)] [CiNii Books]
• D233 分子動力学シミュレーションにおける拡散係数のシステムサイズ依存性(分子動力学1)（2007-11-23） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• 分子動力学シミュレーション専用計算機MDGRAPE-3（2007-04）
• 遊離型及びリガンド結合型酵素間の構造変化メカニズムの分子動力学的研究（2003） [J-GLOBAL]
• 専用計算機ＭＤＧＲＡＰＥ－２を用いた分子動力学シミュレーションの並列化（2003）
• バイオインフォマティクスのための高性能計算機アーキテクチャ（2002）
• 18pTK-8 NaCl-KCl混合系の結晶成長のシミュレーションIII（2001-09-03） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• 29pYH-9 NaCl-KCl混合系の結晶成長のシミュレーション II（2001-03-09） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• 分子動力学専用計算機へのAMBERプログラムの移植開発および実用化に向けた性能評価（2001） [J-GLOBAL]
• 100Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機MDM（2000-11）
• 2000-HPC-82-33 100Tflopsの分子動力学シミュレーション専用計算機MDMの開発状況（2000-08-03） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• 22aZC-1 分子動力学専用計算機MDMの性能評価（2000-03-10） [CiNii Research (CiNii Articles)]
• 16 分子動力学専用計算機 MDM（2000-02-29） [CiNii Research (CiNii Articles)]

Presentations

• int8 行列乗算器を活用した倍精度行列積のエミュレーション手法の実装の最 適化（2025-03-08）
• VRとAIを用いた言語学支援システム（2024-09-03）
• VRを用いたFPGA実験のための遠隔実験システム（2024-09-03）
• 電気通信大学における情報入試体験会の実施結果概要の報告（2024-03-15）
• VR技術を用いたダーツにおけるスローイング動作のトレーニングシステムの開発（2024-03-07）
• スマートフォンで遊ぶマイクロマグネティックシミュレーション（2022-09-02）
• FPGAを用いた12画面タイルドディスプレイシステム（2022-09-02）
• Unity によるマイクロマグネティクスシミュレーションの可視化（2022-03-04）
• レイトレーシング法に特化したGPUによる電波伝搬シミュレーションの高速化（2022-03-04）
• FPGAを用いたフィットネスゲームにおけるリアルタイム運動データ記録支援システムの提案（2021-12-02）
• 重力多体問題を例とした高位合成ツールの性能比較 ～ SDSoCとVitisの違いに関して ～（2021-12-02）
• A Report on the Results of Making a Logic Circuit Design Assignment using an FPGA Remotely Accessible（2021-08-28） [Othres link]
• FPGAを用いた論理回路設計実験の遠隔実践（2020-10-31）
• 等身大の仮想、手の中のリアル（2019-09-22）
• 音源分離を用いた持ち寄りAndroid端末による3Dモデルライブ（2019-09-22）
• FPGAを用いた持ち運び可能なタイルドディスプレイ（2019-09-22）
• 高位合成によるラジオシティ法のソフトウェア/ハードウェア協調FPGAシステム開発（2018-12-05）
• 仮想物理世界で歩き回る論理回路（2018-09-14）
• LeapMotion を用いてVRでイカサマを行える麻雀ゲームの提案（2018-09-14）
• CG 画像向けの True Color から Deep Color への Inverse Tone Mappingの開発（2018-03-14）
• FPGAを用いた6画面タイルドディスプレイシステム（2017-09-16）
• その場でタイルドディスプレイ（2017-09-16）
• 仮想コレクションケースへの展示物配置システム（2017-09-16）
• DS-CUDA によるP2P 機能の評価（2016-09-09）
• FPGA タブレットを用いたDeep Learning アプリケーションの高速化の検討（2016-09-08）
• CUDA Offloading for Molecular Dynamics Simulation（2016-06-01）
• PCI Express拡張Boxと仮想GPUとの計算性能比較（2016-03-11）
• DS-CUDA: GPU Virtualization Middleware to Support Migration Functionality（2016-03-02）
• 自動車運転技術の乗り心地判定及び運転者への助言を行うAndroidアプリの開発（2015-09-26）
• Mixed Reality空間における仮想書斎システムの開発（2015-09-26）
• 数十枚のGPUを手軽に使えるGPU仮想化ツール：DS-CUDA（2015-09-18）
• High Performance Computing on Mobile Devices through Distributed Shared CUDA（2015-03-18）
• Unityアプリケーションのクラウド化による高速化（2015-03-03）
• FPGAタブレットによるモバイルアクセラレータ（2015-03-02）
• Making Logic Circuits with a Single Component in a Virtual Kinematic Environment（2014-10-28）
• マルチGPUの活用を簡単にする仮想化技術（2014-09-26）
• FPGAを用いた3Dタイルドディスプレイシステム（2014-09-17）
• Android向けUnityアプリの仮想化（2014-09-13）
• AndroidアプリからのFPGAの利用による処理の高速化（2014-09-05）
• 仮想物理世界で動く大規模論理回路の実現のための立方体型ゲートの提案（2014-09-03）
• GPU 仮想化による耐故障性を考慮した分子動力学シミュレーション（2014-07-30）
• Logic gates in kinematic virtual environment（2014-05-14）
• モバイルタイルドディスプレイの開発（2014-03-11）
• Running CUDA on Android Through GPU Virtualization（2014-03）
• 対話型アプリケーション向けハンズフリー入力装置の開発（2013-10）
• モバイルタイルドディスプレイの開発（2013-10）
• 国会答弁の言語特徴量と印象の相関調査（2013-09）
• 拡張現実感を用いた 3D モデリングシステムの開発（2013-08）
• GPUによる大規模シミュレーションと支援ツール（2013-06）
• 256GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化（2013-06）
• CUDA Enabled for Android Tablets through DS-CUDA（2013-05）
• DS-CUDAを用いたGPGPUの信頼性向上システム（2013-05）
• GPUによる大規模分子動力学シミュレーション（2013-03）
• 剛体水モデルにおける水/氷共存状態の分子動力学シミュレーション（2012-11）
• 剛体水モデルにおける水/氷共存状態の分子動力学シミュレーション（2012-11）
• GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化（2012-11）
• GPU仮想化による自動冗長計算システム（2012-06）
• 高性能計算を用いた人工生命の研究（2012-06）
• GPUを用いたレプリカ交換分子動力学シミュレーションの高速化（2012-05）
• 大規模GPUとFMMを用いた一様等方性乱流の解析（2011-11）
• 並列GPUによるN体問題の加速（2011-09）
• GPGPUによるモンテカルロ碁のシミュレーションの並列処理（2011-07）
• What the GPU Computing Technology Can or Cannot in the Near Future（2010-07）
• Achieving Enough Accuracy without Double-Precision Hardware to Accelerate Molecular Dynamics Simulations with GPUs（2010-03）
• 分子動力学シミュレーションにおけるParticle Mesh Ewald法のGPUへの実装と評価（2009-10）
• 水/メタン気液界面の分子動力学シミュレーション（2009-06）
• Isotropic Periodic Sum法およびWolf法を用いたMDシミュレーション（2009-06）
• 分子動力学シミュレーションのGPUによる高速化（2009-05）
• Using Special-Purpose and Video-Game Computers for Accelerating Molecular Dynamics Simulations（2008-09）
• Special-Purpose Computers and Video-Game Consoles as a High Performance Computing Platform for Molecular Dynamics Simulation（2007-09）
• Accelerating Molecular Dynamics Simulations by Special-Purpose Computers and Game Consoles（2007-08）
• A High-Speed Special-Purpose Computer for Molecular Dynamics Simulations : MDGRAPE-3（2006-06）

Books and Other Publications

• Petascale Computing: Algorithm and Applications（2008）
• 専用計算機によるシミュレーション（1994）

Works

Research Projects

Media Coverage

• 共通テストへの情報出題まであと1年 現場の動きを探る（2024-01-22）
• CBTでプログラミング技術評価 電気通信大学 注目大学に聞く(3)（2023-07-21）
• おはよう日本（関東甲信越）五輪を目指せ！学生たちの”エリア放送”-東京調布市から中継-（2013-09）
• 朝刊多摩版 来場者へワンセグ番組-電通大生、会場の味スタ周辺限定放送-（2013-09）
• 分子の動き予測PS3で可能に（2008-12）

Industrial Property Rights

• 数値計算処理装置（2006-236256）

Professional Memberships

• 情報処理学会
• IEEE Computer Society
• 人工知能学会
• 電子情報通信学会
• バーチャルリアリティ学会
• ソフトウェア科学会

Committee Memberships

Teaching Experience

• コンピュータサイエンス実験第一
• コンピュータサイエンス実験第一
• コンピュータサイエンス実験第一
• コンピュータサイエンス実験第二A,B
• Computer Graphics
• コンピュータグラフィックス
• Advanced High Performance Computing
• 総合コミュニケーション科学
• コンピュータサイエンス実験第二A,B
• コンピュータサイエンス実験第二A,B
• ハイパフォーマンスコンピューティング特論
• 総合コミュニケーション科学
• 総合コミュニケーション科学
• イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン２
• イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン２
• イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン１
• イノベーティブ総合コミュニケーションデザイン１
• コンピュータサイエンス実験第二
• 計算機工学
• コンピュータ設計論
• エンジニアリングデザイン２
• 情報工学工房
• 大学院技術英語
• エンジニアリングデザイン１
• コンピュータサイエンス実験第二
• コンピュータサイエンス実験第二
• 情報工学工房
• 情報工学工房
• 大学院技術英語
• 大学院技術英語
• コンピュータ設計論
• コンピュータ設計論
• 計算機工学
• 計算機工学
• エンジニアリングデザイン２
• エンジニアリングデザイン２
• エンジニアリングデザイン１
• エンジニアリングデザイン１
• ハイパフォーマンスコンピューティング特論
• ハイパフォーマンスコンピューティング特論

Social Contribution

Academic Contribution